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求助：分子动力学模拟后产生空腔有影响吗？

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x^x

发布时间: 2025-1-8 16:36

正文摘要:

各位老师好，我构建了一个固体-溶液-固体的模型，最上方用真空层填充，固体层冻结，溶液层由水分子及表面活性剂组成，仅使用NVT。分子动力学模拟完成后，在溶液层出现很大的空腔，如图。检索到其他帖子中有老师说 ...

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x^x 发表于 Post on 2025-1-9 11:44:42

sobereva 发表于 2025-1-9 03:05
用一层固体就够了，没这个问题。此时固体的两侧都是液体，统计数据时对两侧取平均。并且开控压避免存在真 ...

谢谢老师的指导，我再优化下建模。

sobereva 发表于 Post on 2025-1-9 03:05:27

x^x 发表于 2025-1-8 21:32
感谢老师的解答。我主要想通过动力学研究表面活性剂在固体层表面的吸附性质，以及溶液中的不同离子对表面 ...

用一层固体就够了，没这个问题。此时固体的两侧都是液体，统计数据时对两侧取平均。并且开控压避免存在真空区

x^x 发表于 Post on 2025-1-8 21:32:00

本帖最后由 x^x 于 2025-1-8 21:58 编辑

sobereva 发表于 2025-1-8 20:54
有什么影响显然取决于你要研究什么，这种事自觉交代清楚

不该用EnerPres

感谢老师的解答。我主要想通过动力学研究表面活性剂在固体层表面的吸附性质，以及溶液中的不同离子对表面活性剂吸附的影响，然后对比一下固体层附近的水分子层的变化。
固体层与溶液层是通过packmol组装到一起的，组装时有试过将固体层与溶液层的间距调小，但进行能量最小化时会报错，组装时将间距调大一点，能量最小化便能正常进行了。

sobereva 发表于 Post on 2025-1-8 20:54:35

有什么影响显然取决于你要研究什么，这种事自觉交代清楚

不该用EnerPres

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