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求助阳离子聚合物传输OH-能量计算

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本主题由 sobereva 于 2025-1-9 21:07 分类

xiaobai1

发布时间: 2025-1-9 20:45

正文摘要:

各位老师好，想请教一个问题，我现在准备算一下我的离子聚合物对OH传输的作用力，图中是我准备算的结构，一般这种离子聚合物会形成离子通道传输OH-(图中以一个重复单元为例），现在就是想计算一下OH-通过这个聚合物 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-1-13 00:52:58

xiaobai1 发表于 2025-1-12 17:01
sob老师您好，这种通过势能面扫描的方法是不是可以解决呢?我画了个简单的草图，但是这种应该变成三维的扫 ...

可以用CP2K或ORCA做NEB计算，得到特定两个位置间迁移的能量最低路径。前者最适合周期性体系（用于孤立体系也可以），后者只适合孤立体系。两个程序做NEB的方法和应用在以下两个培训里也都分别详细讲了，前者讲NEB的篇幅更多
北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）
北京科音高级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KAQC）

北京科音CP2K第一性原理计算培训班给的NEB例子之一，就是考察的迁移路径的能量变化：

sobereva 发表于 Post on 2025-1-11 00:41:02

xiaobai1 发表于 2025-1-10 19:50
感谢sob老师的回复，后面肯定是想加几个重复单元的到电脑能拖得动，现在就是想问问具体是类似结合能那么 ...

你应当关心的是OH-迁移到不同位置时的整个体系的相对能量，而不是聚合物与OH-的结合能

xiaobai1 发表于 Post on 2025-1-10 19:50:06

sobereva 发表于 2025-1-9 21:08
光拿这么一个单体分子没法考察这种问题，都没法表现出聚合物环境。这种问题需要拿实际的聚合物模型做量子化 ...

感谢sob老师的回复，后面肯定是想加几个重复单元的到电脑能拖得动，现在就是想问问具体是类似结合能那么算吗EAB-EA-EB，还是怎么去计算这个过程的能量，MD应该可以，但是想知道用量化计算具体怎么去建立这么个方案

sobereva 发表于 Post on 2025-1-9 21:08:13

光拿这么一个单体分子没法考察这种问题，都没法表现出聚合物环境。这种问题需要拿实际的聚合物模型做量子化学计算（体系适当截断到可以算得动的尺度）或者做周期性的分子动力学模拟（考察传输路径的自由能曲线等）

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