mfdsrax2 发表于 2025-1-13 14:03 口算算错了XD |
wal 发表于 2025-1-12 10:52 5440MB 是 5.4GB |
lyan66 发表于 2025-1-13 13:30 那没办法 你得借服务器 |
wal 发表于 2025-1-12 10:52 噢噢，谢谢。这个是运行内存的嘛，电脑一般都是16或者32对吧，这不够可以怎么调整嘛 |
lyan66 发表于 2025-1-12 10:16 680MW=5440MB 需要54.4个G |
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-1-12 00:55 编辑 lyan66 发表于 2025-1-11 23:03 GaussView的Gaussian Calculation Setup过于简单，DFT里面根本没有M06-2X这个泛函可选（乐）别用那个面板选什么job type创建任务了，现在推荐的做法是GaussView构建结构以后保存为.gjf文件，用文本编辑器自行更改关键词，再提交Gaussian计算。没有opt或者scan之类的关键词时任务类型默认就是单点能计算。 另外如果体系里的分子比较柔性容易变形，弱相互作用受分子形状的影响会很明显，需要考虑借助molclus先在低级别下做预优化及构型/构象搜索，筛选出少数代表性结构后再用DFT跑优化和单点能。 编辑：泛函选择也看看另一篇社长博文http://sobereva.com/272 |
sobereva 发表于 2025-1-11 22:14 谢谢社长解答，我想看它们三者的相互作用，是先用B3LYP-D3(BJ)/6-311G*进行opt freq。然后在用m062x在gaussian中job type中选择energy，进行能量计算吗 |
lyan66 发表于 2025-1-11 21:56 用vmware装个linux虚拟机跑linux版Gaussian，倘若没发生震荡难收敛的麻烦事，用B3LYP-D3(BJ)/6-31G*，2天内凑合。建议在此之前先用像样的半经验方法如Gaussian直接支持的PM6D3或者用xtb里的GFN-xTB做个结构的预优化，比起上来就用DFT优化能节约大量时间。 |
sobereva 发表于 2025-1-11 21:28 社长，谢谢上面解答。我看您这个http://sobereva.com/83推荐弱相互作用是用M06-2x，是不是opt 和freq用您说的这个B3LYP-D3(BJ)/6-311G*，然后在计算单点能时用m06-2x，看相互作用。作为opt和freq能直接看相互作用嘛，如果可以的话是不是不需要在m06-2x了。 |
本帖最后由 lyan66 于 2025-1-11 22:00 编辑 sobereva 发表于 2025-1-11 21:28 好的，谢谢社长，我下次注意。目前手上只有windows电脑，这个需要很久嘛，20核，20内存，2天时间够优化吗 |
|
根本不存在6-311G+，别乱写基组名，认真看 计算化学中的一些常见不良写法和用词 http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html） opt freq用B3LYP-D3(BJ)/6-311G*，仔细看 谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html） 溶剂模型改成IEFPCM M06-2X结合SMD做opt freq算柔性体系完全是自讨苦吃，仔细看上文和下文 谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算 http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html） M06-2X是我非常不建议用来做opt freq任务的泛函 较大体系绝对甭用Windows版Gaussian做DFT优化，慢得要死，下文明确说了 Gaussian的安装方法及运行时的相关问题 http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html） |
| 如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “泛函选择” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-16 18:32 , Processed in 0.194000 second(s), 25 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites