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关于过渡态搜寻直接得到对应产物的问题

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wang011127

发布时间: 2025-2-4 18:42

正文摘要:

本帖最后由 wang011127 于 2025-2-4 18:48 编辑在优化一个DA反应，如图，设定了如下的初猜作为初始输入，使用# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq wb97xd/6-31g(d) scrf=(iefpcm,solvent=water)作为输入选项是 ...

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wang011127 发表于 Post on 2025-2-5 13:15:49

wal 发表于 2025-2-5 13:06
你先按原文的软件和级别做个freq试试一上来就下"该过渡态搜寻并不合理"这种结论有点哈人了

而且你计 ...

不不不，我的意思是我的操作有问题，不是说文献有问题

wal 发表于 Post on 2025-2-5 13:06:37

本帖最后由 wal 于 2025-2-5 13:07 编辑

wang011127 发表于 2025-2-5 12:49
不一样的，我只是将他的坐标作为初猜输入，我用的g16代替g09，计算级别从B3LYP/6-31G(d)改为了wb97xd/6-3 ...

你先按原文的软件和级别做个freq试试一上来就下"该过渡态搜寻并不合理"这种结论有点哈人了

而且你计算级别变化这么大原来的结构当初猜也不一定合适了

wang011127 发表于 Post on 2025-2-5 12:49:07

wal 发表于 2025-2-5 12:26
你跟文献用的软件版本还有计算级别一样吗

不一样的，我只是将他的坐标作为初猜输入，我用的g16代替g09，计算级别从B3LYP/6-31G(d)改为了wb97xd/6-31G(d)，并额外添加了水的隐式溶剂模型作为修正

wal 发表于 Post on 2025-2-5 12:26:41

wang011127 发表于 2025-2-4 19:46
用文献过渡态坐标进行计算得到的结果有很小的虚频，而且振动方向并不是成键方向，同时得到的过渡态1号与9号 ...

你跟文献用的软件版本还有计算级别一样吗

tonganlhy 发表于 Post on 2025-2-4 21:02:57

过渡态的搜索是个精细活。用xtb先看一下。

wang011127 发表于 Post on 2025-2-4 19:46:52

用文献过渡态坐标进行计算得到的结果有很小的虚频，而且振动方向并不是成键方向，同时得到的过渡态1号与9号原子，2号与6号原子完全成键，可以认定该过渡态搜寻并不合理

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