这个我就没有了。你先去搜一下DA酶的相关文献吧。不过有机界ms对这个酶一直不感冒,认为一般就是提供一个环境让两个分子挤到一起能够反应,就像on water一样。 |
tonganlhy 发表于 2025-2-17 18:33 嗯嗯我试试看,请问有没有相关详细计算方案的介绍? |
wzkchem5 发表于 2025-2-17 18:52 好的,感谢 |
wang011127 发表于 2025-2-17 11:31 可以查一下酶催化反应相比uncatalyzed反应的最大加速比是多少,应该有这方面的实验数据。然后用Eyring方程换算成活化自由能降低多少kcal/mol |
wang011127 发表于 2025-2-17 18:32 水提供氢可以当路易斯酸。可能还可以通过水把两个分子拉近一点。不过这个可能性就很多了。我觉得你可以先搞搞残基当路易斯那个比较容易一点。 |
tonganlhy 发表于 2025-2-17 17:50 如果真的有水参与的话,请问您有什么思路可以把水分子合理安排在这个体系中吗,想请教一下,感谢! |
wzkchem5 发表于 2025-2-17 18:17 请问您有例子可以作为参考嘛,我也可以用这个和老师去argue一下,非常感谢 |
酶催化把活化能降低15kcal/mol也并不罕见。可以实际用一个酶里常见的基团,尝试计算一下催化反应,例如用一个质子化的Glu或者Arg和内酯羰基氧形成氢键,看能把自由能垒降低多少 |
你这个是在水体系的,过渡态可能要考虑水分子参与。加残基当然是可以的,更能证明催化的必要性。 |
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