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发布时间: 2025-2-18 23:03
正文摘要:本帖最后由 alee1046 于 2025-2-19 12:28 编辑 各位老师好 按照sob老师gromacs培训班金属模拟教程的例子 我试着gmx进行au原子的真空模拟 在atp文件和itp文件都加入了au的参 ... |
sobereva 发表于 2025-2-19 18:09 感谢sob老师 已解决 |
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要么用gromacs老版本，要么pbc=xyz、盒子留出足够真空区 倘若Au的定义严格按照讲义恰当加到了当前用的力场的ffnonbonded.itp的[atomtypes]部分，绝对不会出现找不到原子类型的提示 |
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认真看 在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚 http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html） 不要就说个“按照sob教程”，谁知道你具体指什么。如果是指北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）培训里我讲金属模拟的例子，把这点说清楚。 |
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