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CP2K分子动力学计算 力场参数单位如何确定?

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发布时间: 2025-2-21 23:30

正文摘要:

大家好:   量子计算有时候很费时间,在要求不高的情况下,用分子动力学(FIST)模拟也是个不错的选择。 不过力场设置不好,总会出现              “GEOMETRY ...

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lywbanner 发表于 Post on 2025-2-22 12:25:21
多谢指点!实际上我做个测试,将来扩胞用到大的体系上,然后上面吸附团簇,进而吸附小分子催化。
这样的话,DFT计算就十分吃力了,因此采用QMMM,基底用MM,上面活性部分用QM。
这时候,运行速度会大大加快,可以搜索到更多构型。
sobereva 发表于 Post on 2025-2-22 09:06:02
这么小的体系,鼓捣分子力场设置的功夫,DFT都跑完了,结果还更精确

CP2K做MM计算要掌握很多知识和逻辑才能正确使用,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)里面给了详细的介绍和诸多例子,其中和当前问题相关的一页:


Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-2-22 01:11:01
不是,难道计划研究的体系尺寸大到DFT算不动、研究目标又不需要对电子状态描述准确的结论吗?(而且DFT这种量子化学方法的计算不能简称为“量子计算”,看http://sobereva.com/680)就算DFT算不动也还有GFN-xTB呢。

这种结构在CP2K里恰当设置DFT不可能处理不了,真有什么问题不如直接拿出来(比如因为SCF收敛困难而算得慢,就按http://sobereva.com/665仔细排查),而不是绕弯路折腾什么经典分子力场;即便模拟很快,把找参数、设置输入的准备流程也算上可能根本就省不下多少时间,而且结果能否被认可而发表都十分存疑。单说相互作用势函数及单位的设置就有GENPOT字段的一堆讲究,真心不建议缺乏经验就贸然尝试。

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