跑双蛋白配体复合物动力学模拟遇到问题

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发布时间: 2025-2-22 19:18

各位老师好，我跑的双蛋白配体复合物的动力学模拟，跑完之后打开md.gro文件出现了图1的情况问题1：图1这种是周期性边界问题吗？问题2：这种情况能继续用来RMSD,RMSF等的分析吗？跑完双蛋白配体复合物的动力 ...

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lmtt 发表于 Post on 2025-2-23 09:36:49

sobereva 发表于 2025-2-22 20:38
1 是

3 是

好的，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2025-2-22 20:38:01

1 是

3 是
引用我博文时要给出出处
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627（http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html）

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