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TinkerModeller: 专注于Tinker AMOEBA可极化力场的建模软件

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Huschein

发布时间: 2025-2-28 07:36

正文摘要:

本帖最后由 Huschein 于 2025-3-1 22:03 编辑 TinkerModeller: An Efficient Tool for Building Biological Systems in Tinker Simulations 极简概括：我们为分子动力学软件Tinker设计了一套建模软件，专门用于 ...

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Huschein 发表于 Post on 2025-3-15 08:05:38

沽宁发表于 2025-3-14 09:35
可以计算背景电荷影响下的极化能吗？

我不确定你说的这个方法的具体含义，但是目前肯定没有实现这个方法

不过作为这个软件的开发者，我正在积极维护与更新这个软件，如果你认为有需要，可以邮件我我们可以考虑实现这个功能

沽宁 发表于 Post on 2025-3-14 09:35:05

可以计算背景电荷影响下的极化能吗？

mizu-bai 发表于 Post on 2025-2-28 14:44:02

good job

2877321934 发表于 Post on 2025-2-28 09:56:58

Huschein 发表于 2025-2-28 09:43
我不太清楚你说的那个我没用tinker做过qmmm 但是这个可以为tinker进行amoeba建模如果更复杂的东西进来 ...

好的，谢谢回复

Huschein 发表于 Post on 2025-2-28 09:43:43

2877321934 发表于 2025-2-28 08:26
感谢分享，请问大佬这个软件对于openmolcas+tinker联用做QM/MM的用途大吗？我们主要用MM层描述溶剂和蛋白质 ...

我不太清楚你说的那个我没用tinker做过qmmm 但是这个可以为tinker进行amoeba建模如果更复杂的东西进来我不确定行不行但是有任何问题和开发需求可以去github提issue 我们会长期更新

2877321934 发表于 Post on 2025-2-28 08:26:42

感谢分享，请问大佬这个软件对于openmolcas+tinker联用做QM/MM的用途大吗？我们主要用MM层描述溶剂和蛋白质外围

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