求助过渡态出现在成键区域

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发布时间: 2025-3-5 09:44

各位老师们好。近期对PhIO+F-MnⅢ(卟啉)过渡态进行搜寻。Ⅰ：第一个图进行了柔性扫描选取了能量最高点，mn-o距离1.96，Ⅱ：选这个结构进行过渡态搜索，使用的关键词（# opt=(calcfc,ts,noeigen ...

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RAL 发表于 Post on 2025-3-5 17:33:40

jyl2 发表于 2025-3-5 15:03
我计算了键级#7: 1(Mn) 69(O )0.66396086，这个数值快接近1了，但是他们成键其实是两对电子。那我该怎么 ...

这个过渡态是对的。至于怎么解释，你要学习更多Mayer键级的知识。

jyl2 发表于 Post on 2025-3-5 15:03:33

Solitude198 发表于 2025-3-5 11:44
这玩意只是gaussview自动根据距离生成的键，真要看成键没有去算算键级或者做个IRI图看看

我计算了键级#7: 1(Mn) 69(O )0.66396086，这个数值快接近1了，但是他们成键其实是两对电子。那我该怎么解释呢？

Solitude198 发表于 Post on 2025-3-5 11:44:06

jyl2 发表于 2025-3-5 10:23
您好。400i虚频振动模式对应的是O转移，但是这个成键我应该怎么去解释呀，是否是泛函以及基组选择不合理 ...

这玩意只是gaussview自动根据距离生成的键，真要看成键没有去算算键级或者做个IRI图看看

jyl2 发表于 Post on 2025-3-5 10:23:24

RAL 发表于 2025-3-5 10:09
这个400i的虚频振动模式对应O转移吗？对应的话那过渡态应该是正确的。
如果是其他无关的虚频的话，需要扫 ...

您好。400i虚频振动模式对应的是O转移，但是这个成键我应该怎么去解释呀，是否是泛函以及基组选择不合理。

RAL 发表于 Post on 2025-3-5 10:09:48

这个400i的虚频振动模式对应O转移吗？对应的话那过渡态应该是正确的。
如果是其他无关的虚频的话，需要扫描Mn-O成键与I-O断键协同的反应模式，可使用Gaussian的GIC功能实现。

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