sobtop在生成top文件过程中调用openbabel时闪退

查看数: 608 | 评论数: 9 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2025-3-6 21:45

按照例5的生成聚合度为40的聚合物拓扑文件步骤的调用openbabel计算mmff94文件时闪退（已按提示更换了openbabel的实际路径），使用的mol2文件为例子提供的文件，现在不清楚是哪一步存在问题，请老师们解答！谢谢！

回复 Reply

qyl 发表于 Post on 2025-5-21 11:20:08

同学，可以分享一下Linux系统的openbabel安装包吗？

凯亚 发表于 Post on 2025-3-7 20:54:20

sobereva 发表于 2025-3-7 18:41
确保openbabel版本用的和我的一样
并且把sobtop目录放到其它地方再试
也可以自己手动运行openbabel命令 ...

好的，换了目录试了试可以运行了，谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2025-3-7 18:41:31

凯亚发表于 2025-3-7 17:05
报错的图片已经上传，提示貌似是什么文件找不到，老师这种情况一般是什么问题引起的

确保openbabel版本用的和我的一样
并且把sobtop目录放到其它地方再试
也可以自己手动运行openbabel命令（与sobtop提示的命令相同）看是什么情况

凯亚 发表于 Post on 2025-3-7 17:05:52

sobereva 发表于 2025-3-7 06:24
我这里没有任何问题

报错的图片已经上传，提示貌似是什么文件找不到，老师这种情况一般是什么问题引起的

凯亚 发表于 Post on 2025-3-7 13:20:01

sobereva 发表于 2025-3-7 06:24
我这里没有任何问题

运行报错提示好像是这样的，一运行特别快就闪退了

sobereva 发表于 Post on 2025-3-7 06:24:00

我这里没有任何问题

在命令行下运行看报错提示

凯亚 发表于 Post on 2025-3-6 22:45:38

Lance先生发表于 2025-3-6 22:03
上传一下必要的文件呢？

文件用的就是例子示范文件，已上传

Lance先生 发表于 Post on 2025-3-6 22:03:08

上传一下必要的文件呢？

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register