sobereva 发表于 2025-3-10 22:44 感谢老师的指点 |
txhbd 发表于 2025-3-10 21:17 先确保没改过的代码能正常编译，并且参考以下视频（部分情况与当前版本有异） Multiwfn 3.6 Windows版在VS2017+ifort 2019下的编译过程演示 https://www.bilibili.com/video/av41401928/ 并且注意完整阅读编译过程的所有输出信息 如果还死活弄不成功就在linux下编译 |
sobereva 发表于 2025-3-8 23:38 感谢sob老师的回复及提醒，下次谨记。 |
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若要得到每个表面顶点的静电势数值，Multiwfn主功能12做完表面静电势分析后选择7 Export all surface vertices to vtx.txt in current folder，并且看屏幕上的提示 如果你非得要每个表面小碎片（小三角）对应的面积和静电势数值（基于对应的三个表面顶点的静电势数值插值得到），需要修改Multiwfn源代码导出，对应surfana.f90里的surtriang数组的area和value属性 提到MSMS完全莫名其妙，纯粹瞎走弯路 |
| 帖子标题不得乱用叹号，置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。这次给你改了，下次乱用叹号直接删帖扣分处理。 |
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-8 12:06 感谢您的回复，MSMS是指您链接所发的软件。目标公式（计算“原子”亲水亲脂指数）涉及的描述符太多，我怕解释不清反而进行误导，因此只咨询了“如何计算原子局部范德华表面点r处的坐标、静电势、面积元素”。我拜读了Sob老师进分享的《谈谈怎么计算化学系中的“原子的静电势”》，通过方法2可以得到原子局部范德华表面点r处的坐标及静电势，但是不会计算表面点r处的面积元素。您提及的《使用Multiwfn和VMD计算分子表面记和片段表面积》可以计算局部范德华表面的总面积，并不能给出范德华表面每个表面点的面积元素。原文献给出的方法似乎是根据MSMS工具来实现的（原文原文附在附件上），因此我尝试使用MSMS工具，但不会操作。我也搜索了其他软件，如VMD、PyMOL等可视化工具，均无法直接获取面积元素（或许需要借助脚本），最后可能都需要借助MSMS工具来计算。 |
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MSMS是指https://ccsb.scripps.edu/msms/这个软件？没看懂目标计算公式是怎么和这个软件联系上的，最好多解释下出处、物理意义及其应用，或许还有其他更新更常用的软件能直接得到最终你想要的物理量，也省得折腾中间过程…… 猜你关心： 使用Multiwfn和VMD计算分子表面积和片段表面积 http://sobereva.com/487（http://bbs.keinsci.com/thread-13392-1-1.html） Multiwfn可以计算的分子描述符一览 http://sobereva.com/601（http://bbs.keinsci.com/thread-23729-1-1.html） 静电势与平均局部离子化能相关资料合集 http://bbs.keinsci.com/thread-219-1-1.html |
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