季胺中N原子的RESP电荷的问题

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发布时间: 2025-3-11 11:15

本帖最后由 yuechenghua 于 2025-3-11 15:40 编辑各位老师们好！因为做MD的原因，需要计算RESP电荷，结构就是将哌啶季胺化后得到了这样一个带正电的结构。

回复 Reply

zjulfp 发表于 Post on 7 day ago

yuechenghua 发表于 2025-3-12 09:47
好的，感谢社长！

你好，可以问一下这个参考文献是哪一篇吗？我的体系也想参考一下，谢谢楼主。

yuechenghua 发表于 Post on 2025-3-12 09:47:04

sobereva 发表于 2025-3-12 03:50
体系、构象不一样的情况下没有可比性
况且那是被包埋得很深的N原子，数值不确定性本来就大

好的，感谢社长！

sobereva 发表于 Post on 2025-3-12 03:50:43

yuechenghua 发表于 2025-3-11 15:38
感谢社长！下面是那篇文献SI里的单体结构图和每个原子的RESP电荷，我要模拟的聚合物和他们的很类似。这篇 ...

体系、构象不一样的情况下没有可比性
况且那是被包埋得很深的N原子，数值不确定性本来就大

sobereva 发表于 Post on 2025-3-11 11:48:19

没有任何必然问题
我不知道你说的文献里是什么类似结构。当前体系是阳离子，N不带明显的负电荷非常正常

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