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计算溶解自由能误差过大,复现文献失败

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发布时间: 2025-3-17 11:20

正文摘要:

各位大神,我打算复现这篇文献中溶解自由能的计算,考虑了我认为的所有因素,可是最后误差还是在0.5个电子伏特左右,属于复现失败了,想问问大家我的计算文件有什么问题吗?或者影响最终结果的因素有哪些?(介电常数 ...

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wwwwwt 发表于 Post on 2025-3-17 14:47:08
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-17 14:24
这个锂盐作为电解质,溶于有机溶剂形成(较稀的)电解液时应该解离为阴离子和阳离子,这样才能在电池工作 ...

1.这是文献的doi:https://doi.org/10.1038/s41586-024-08465-y
2. 文献里关于溶剂模型,提及了,是使用隐式溶剂模型
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-3-17 14:24:35
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-3-17 14:27 编辑
wwwwwt 发表于 2025-3-17 13:56
谢谢您
1. 确定是计算前者
2. 没考虑过,我不太了解,您能就此介绍一下嘛?

这个锂盐作为电解质,溶于有机溶剂形成(较稀的)电解液时应该解离为阴离子和阳离子,这样才能在电池工作时在电场下传导锂离子嘛。当前的文件相当于计算整个盐溶解CH3SO2Li(gas) → CH3SO2Li(sol)的过程,没有考虑到实际会发生的解离CH3SO2Li(sol) → CH3SO2-(sol) + Li+(sol)的过程。可以参考http://sobereva.com/733对结合能的讨论。我说的溶剂配合的问题主要在表现Li+(sol)这个结构上,因为锂离子半径小、电荷密度高,其与溶剂氧原子等的相互作用不能忽略,所以应当将溶剂分子显式地画出来并添加到反应式里,可以参考http://sobereva.com/327的第2节第(8)小节对单原子离子的说明,或者考虑第(9)小节说的另一个溶剂模型。

编辑:上述因素是准确计算溶解自由能可能需要考虑的,至于复现文献计算的问题,因为没给原文的链接(段落的截图仍不够完整)也不好判断哪些因素被考虑了;如果文献不够严谨,复现意义就减小了,硬要复现的话不如咨询作者在文章中没说清楚的细节。
wwwwwt 发表于 Post on 2025-3-17 14:01:15
wzkchem5 发表于 2025-3-17 12:30
你用的构象和文献是否相符?

文献中CH3SO2-分子结构较简单,我也用文献中相同泛函基组几何优化了,是相符的
wwwwwt 发表于 Post on 2025-3-17 13:58:15
sobereva 发表于 2025-3-17 12:30
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678(http://bbs.keinsci.com/thread ...

谢谢卢皇
wwwwwt 发表于 Post on 2025-3-17 13:57:09
sobereva 发表于 2025-3-17 12:30
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678(http://bbs.keinsci.com/thread ...

谢谢卢皇
wwwwwt 发表于 Post on 2025-3-17 13:56:42
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-17 12:45
我怎么记得用SMD隐式溶剂模型计算溶解自由能的时候应该用M05-2X/6-31G*级别来着

另外,甲亚磺酸根CH3SO2 ...

谢谢您
1. 确定是计算前者
2. 没考虑过,我不太了解,您能就此介绍一下嘛?
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-3-17 12:45:38
我怎么记得用SMD隐式溶剂模型计算溶解自由能的时候应该用M05-2X/6-31G*级别来着

另外,甲亚磺酸根CH3SO2- (methanesulfinate)和甲磺酸根CH3SO3- (methanesulfonate)是两个不同的阴离子,确定现在要计算的是前者的锂盐吗?以及考虑过锂盐溶解后离子解离及溶剂配合的过程么?
sobereva 发表于 Post on 2025-3-17 12:30:27
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678http://bbs.keinsci.com/thread-38911-1-1.html
wzkchem5 发表于 Post on 2025-3-17 12:30:22
你用的构象和文献是否相符?

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