求助：请教大家这种室温构象变化图所需的数据如何得到？

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发布时间: 2025-3-18 11:13

ps:文章没有提及是刚性扫描还是柔性扫描。

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喵星大佬 发表于 Post on 2025-3-21 12:28:41

想体现室温的影响只能是通过热浴控制在室温下跑足够长时间的MD然后统计轨迹在待分析的这个集约变量(CV)上的投影，即获得一维的自由能分布(自由能面在该CV上的投影)

fffmmmzck 发表于 Post on 2025-3-20 09:27:36

sobereva 发表于 2025-3-19 13:25
当前没体现什么“室温”
仔细看下文
详谈使用Gaussian做势能面扫描

目前我的理解室温只是一个作者限定的前提条件；感谢sob老师提供的博文，我会认真学习一下。

fffmmmzck 发表于 Post on 2025-3-20 09:25:11

naonao5205 发表于 2025-3-18 11:27
横坐标是关心的信息
推测应当是柔性扫描
对要研究的结构柔性扫描关心的几何信息即可得到每个点的结构，然 ...

好的

sobereva 发表于 Post on 2025-3-19 13:25:08

当前没体现什么“室温”
仔细看下文
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）
谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响
http://sobereva.com/423（http://bbs.keinsci.com/thread-10159-1-1.html）

naonao5205 发表于 Post on 2025-3-18 11:27:26

横坐标是关心的信息
推测应当是柔性扫描
对要研究的结构柔性扫描关心的几何信息即可得到每个点的结构，然后研究关心的性质即可

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