计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

欢迎试用在线分子,波函数,轨迹显示与编辑软件qMolStar

查看数: 4071 | 评论数: 23 | 收藏 Add to favorites 41
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2025-3-18 17:26

正文摘要:

本帖最后由 coolrainbow 于 2025-3-18 17:34 编辑 大家好,我们非常高兴和大家宣传一下我们最近的一个工作。开源软件MolStar (Mol*)是一个非常优秀的在线分子可视化程序,但是该程序主要适用于生物分子显示,不 ...

回复 Reply

quanta 发表于 Post on 2025-4-9 15:15:58
本帖最后由 quanta 于 2025-4-9 15:19 编辑

vscode里面有个叫protein viewer的扩展


coolrainbow 发表于 Post on 2025-4-3 13:37:00
TinnKuka 发表于 2025-4-2 21:31
请问为什么在拖入文件的时候显示“Error: Error:    undefined    网络请求错误”? 我换了不同的网络都是这 ...

Sorry,服务器刚换了https协议,部分网络服务当时还没来得及换,现在应该好了
TinnKuka 发表于 Post on 2025-4-2 21:31:23
请问为什么在拖入文件的时候显示“Error: Error:    undefined    网络请求错误”? 我换了不同的网络都是这样。
Graphite 发表于 Post on 2025-3-28 20:30:38
这个有点太猛了,我们的工作正欠缺这一点。
我们在做简单量化/分子模拟的AI服务,也就是通过简单语言文本输入设计计算流程、自动执行计算的过程,设计出linux指令或者选择正确的模板参数不太难, 生成正确的研究逻辑也有了框架。正想着怎么简化最初级使用者的操作——简化初始结构输入。从工程角度来说,这个最后一公里很可能是最遥远的距离。
coolrainbow老师的工作给了我们很大启示。
zjxitcc 发表于 Post on 2025-3-24 18:12:58
coolrainbow 发表于 2025-3-19 19:58
当前这个程序已经支持PBC了,包括显示超胞,不过还在继续优化

请问一下,我载入一个金刚石cif文件,显示这样是正常的吗(网站还有待改进的意思)?

Keys 发表于 Post on 2025-3-23 13:26:07
尝试去建了一个模型,还是很方便的,操作手册如果更详细一点应该会更方便新手入门使用

202503231322538465..png (87.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

202503231322538465..png

202503231323347511..png (6.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

202503231323347511..png
exity 发表于 Post on 2025-3-19 21:34:16
看完回帖,感觉天下苦chemDraw+3D久也~
coolrainbow 发表于 Post on 2025-3-19 20:01:12
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-19 17:33
要不再集成一个画键线式的工具(比如Ketcher或者ChemDoodle),画完直接AI识图生成三维结构,实现收费的某D ...

chemdoodle+3D试别确实可以有
coolrainbow 发表于 Post on 2025-3-19 19:59:31
wzkchem5 发表于 2025-3-19 17:46
这个AI一键识别太酷了,可否识别化学反应?以及在预先自定义R基的情况下,给一个含R基的分子结构,AI模型生 ...

要做这个,请先给我两个研究生
coolrainbow 发表于 Post on 2025-3-19 19:58:37
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-19 17:33
要不再集成一个画键线式的工具(比如Ketcher或者ChemDoodle),画完直接AI识图生成三维结构,实现收费的某D ...

当前这个程序已经支持PBC了,包括显示超胞,不过还在继续优化
coolrainbow 发表于 Post on 2025-3-19 19:57:11
lanthanum 发表于 2025-3-19 16:44
把这个作为前端,将ABCluster功能都接入该多好啊。

会做的,但是现在task list很长,要慢慢来
coolrainbow 发表于 Post on 2025-3-19 19:56:38
gentle 发表于 2025-3-19 15:04
老师很厉害啊,这工具有考虑开源吗?molstar可以很方便的嵌入前端工程,也有streamlit上的实现,如果想用老 ...

再等一段时间,功能再多一些,反馈的bug再修复一些,会开源的
neocc 发表于 Post on 2025-3-19 19:10:59
本帖最后由 neocc 于 2025-3-19 19:13 编辑

棒~
之前在vscode里面有个基于mol*的插件,初次使用非常惊艳,10w原子的pdb秒开渲染效果也很棒,苦于迁移学习成本太高,还是回到了vmd。
张老师做的这个网站兼容vmd操作,非常适合新手入门。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 15:19 , Processed in 0.363877 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list