beefly 发表于 2025-3-19 18:49 您好老师，我是想看分子中的原子轨道的在平衡核间距处的重叠情况。我用molpro计算得到的.molden文件只是一个点的波函数文件，但是我画图时应该是需要每个R处的.molden文件，我这样想对吗？如果对的话，在molpro中如何得到每个点的.molden文件呢？ |
sobereva 发表于 2025-3-20 04:18 谢谢老师 |
hehe 发表于 2025-3-19 18:59 你贴的那个图意义不明 若要从分子中还原出原子轨道，可以用Multiwfn基于NBO程序给出的NAO轨道绘制 我只能告诉你Multiwfn绘制rdf的功能对任何体系都是普适的，只要提供波函数文件就行，Multiwfn支持的波函数文件情况在下文说得非常完整，molpro的molden文件被Multiwfn直接支持 详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换 http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html） 另参考 电子空间范围<r^2>和电子径向分布函数的含义以及在Multiwfn中的计算 http://sobereva.com/616（http://bbs.keinsci.com/thread-25075-1-1.html） |
sobereva 发表于 2025-3-19 18:21 您好老师，我更新了一下帖子。我想仿照LrF的径向分布函数图，绘制我的体系的径向分布函数图。 我的疑惑是molpro得到的.molden文件是针对于分子的，我看到您的贴子里谈到关于用高斯绘制原子的径向分布函数的方法，那么对于分子的话是不是需要将.fch文件中分子轨道分解回原子轨道，然后进行绘制呢？ 还有一个问题是我用molpro得到的.molden文件利用multiwfn转换成.fch文件，进行径向分布函数的绘制是否可行呢？ |
| 如果你说的是那种带节点的径向分布，可以先绘制一维的径向电子密度，并保存数据文件。然后手工编辑数据，把密度值乘以球面积（如果只关心曲线形状，也可以直接乘以r^2），然后用matlab、origin画图 |
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分子没有一般意义的原子轨道（除非是指NAO轨道之类） 如果你指具有原子轨道特征的分子轨道（如下文说的里德堡轨道），可以 图解电子激发的分类 http://sobereva.com/284（http://bbs.keinsci.com/thread-840-1-1.html） |
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