MOMAP计算分子重组能异常

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发布时间: 2025-3-22 09:53

各位大佬，小弟在使用momap做振动耦合计算的时候发现重组能大的有些异常，求助可能的原因是什么？

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李永航 发表于 Post on 2025-5-7 19:48:26

是柔性八元环结构，感谢大神，我再去尝试重新优化。

slxc920113 发表于 Post on 2025-5-7 17:42:34

两个态的原子顺序保持一致，建议优化完S0，再用S0的结构作为初始输入的结构优化T1或者S1。如果仍然很大，可能激发态优化到了另一个FrankCondon区间，可以用激发态的结构作为输入，重新优化S0.

804719194 发表于 Post on 2025-5-7 17:18:49

李永航发表于 2025-5-7 17:05
内坐标输出的是7万，直角坐标输出的是百万级别的，两个结果貌似都不合理

体系是不是有柔性链？不行的话貌似只有重新优化了

李永航 发表于 Post on 2025-5-7 17:05:37

cokie 发表于 2025-5-7 12:09
momap 出两个重组能，一个是基于笛卡尔坐标的（cart），一个是内坐标的（int），如果这两个输出结果相差 ...

内坐标输出的是7万，直角坐标输出的是百万级别的，两个结果貌似都不合理

cokie 发表于 Post on 2025-5-7 12:09:35

李永航发表于 2025-5-7 09:53
同问，RMSD=0.45，变化很小。重组能7万

momap 出两个重组能，一个是基于笛卡尔坐标的（cart），一个是内坐标的（int），如果这两个输出结果相差较小，则选用笛卡尔坐标所输出的重组能，否则就使用内坐标输出的重组能

李永航 发表于 Post on 2025-5-7 09:53:03

同问，RMSD=0.45，变化很小。重组能7万

804719194 发表于 Post on 2025-3-22 15:59:17

wal 发表于 2025-3-22 10:23
有可能是结构变化太大破坏谐振近似了

好的，感谢解答

wal 发表于 Post on 2025-3-22 10:23:54

有可能是结构变化太大破坏谐振近似了

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