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给不同氨基酸进行着色，氨基酸和氨基酸之间的那条键没了求助

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人生若只如初见

发布时间: 2025-3-29 09:45

正文摘要:

老师们好，就是我想问问我在vmd中通过语句给不同的氨基酸进行上色，颜色是整成功了，但是氨基酸和氨基酸之间的那条键没了，这个应该怎么加上呢

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人生若只如初见 发表于 Post on 2025-3-29 21:22:10

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-3-29 10:42
现在设置的多个rep的选区都仅限于残基名相同的部分，自然显示不出来残基之间的键哦。

实际上按残基着色 ...

明白了谢谢您

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-3-29 10:42:48

现在设置的多个rep的选区都仅限于残基名相同的部分，自然显示不出来残基之间的键哦。

实际上按残基着色只需要一个rep，选区就用覆盖整个蛋白质的all或者protein即可（在Selections栏的Singlewords里面可以看到选项），着色方式不用Color ID而是ResName。残基与颜色的默认对应关系可以在VMD目录下scripts/vmd/colordefs.dat里面看到，如果想更改可以打开主菜单Graphics - Colors窗口，Categories选择ResName、Names选择残基名来改，也推荐在这之前打开File - Log Tcl Commands to Console在命令行查看对应指令的写法。

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