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本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-8-3 01:36 编辑 补充一点信息,目前文中提到的软件里GaussView、Chemcraft收费(但应该比不过某工作室),OVITO有免费版也有收费的Pro版,其他如multiwfn、VMD、VESTA、Avogadro、JMol/JSmol等皆免费。如果已经购买有gv或者M$等软件的许可的话用就用了,没买的话把几个免费软件用熟练了也能满足很大部分需求。还有兴趣的话同样免费的ChimeraX、CYLview和IQmol也可以看一看,不过这些更多面向小分子和生物分子之类。 说实话VESTA有种被低估的感觉,实际上如http://bbs.keinsci.com/thread-26432-1-1.html分享的教程所示其功能挺丰富的。在周期性体系建模上,VESTA有个很重要的功能是根据自定义变换矩阵来修改晶格矢量(gview似乎直到6.1.1都尚未直接支持?),之前我这帖有个简单用例。 编辑:之前说了一句“还不够就再加上packmol、atomsk甚至vaspkit等”,不过这些更多是建模工具,有点偏题了……如果扩展到所有CP2K相关工具的话,官方的https://www.cp2k.org/tools页面也有列举。会写python代码的可以看看ase(https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/about.html)、ash(https://ash.readthedocs.io/en/latest/About.html)和pymatgen库,不过python生态之多样难以尽数。同样基于python生态的还有DockOnSurf、ABCluster、molSimplify等。 |
参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
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首先,感谢社长非常伟大的工作!吾辈楷模!![]() 我有两个cp2k可视化的需求遇到了瓶颈,可能要麻烦社长再指点一二: 1.如何可视化部分的电荷密度,定义可参考:https://mcresearch.github.io/abacus-user-guide/abacus-chg.html 2.如何使用cp2k计算并可视化LDOS,对应手册里的这些部分: https://manual.cp2k.org/trunk/CP ... RINT/PDOS/LDOS.html https://manual.cp2k.org/trunk/CP ... NT/PDOS/R_LDOS.html 感激不尽! |
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