计算二价钴离子（Co2+）与一个分子的相互作用，高斯结构优化报错，看不懂out文件

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发布时间: 2025-4-1 11:36

Sober老师，我在计算二价钴离子（Co2+）与一个分子的相互作用，用同样的关键词，单独优化这个分子和Co2+的时候，都比较正常，但我把Co2+与这个分子做成复合物以后，几分钟就终止了，终止的原因看不太懂，网上也搜了 ...

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tonganlhy 发表于 Post on 2025-4-2 10:18:03

weiyongswust 发表于 2025-4-2 10:15
是水相，模拟的那个中性分子对钴离子的吸附。你说的加几个水，还有显示溶剂，不太懂是啥，在关键词加scrf ...

加这个只是模拟溶剂的偶极等等环境，并不能展示钴跟水的配位。你要考虑你这个分子大概能有几个位点能配上钴，然后考虑钴的配位数，补上相应的水分子的数目。

weiyongswust 发表于 Post on 2025-4-2 10:15:35

tonganlhy 发表于 2025-4-2 10:11
你这个是水相吗？估计得加上几个水用显式溶剂模型才可以。光秃秃的金属离子能量太高

是水相，模拟的那个中性分子对钴离子的吸附。你说的加几个水，还有显示溶剂，不太懂是啥，在关键词加scrf(smd, solvent=water)，可以吗？

tonganlhy 发表于 Post on 2025-4-2 10:11:33

你这个是水相吗？估计得加上几个水用显式溶剂模型才可以。光秃秃的金属离子能量太高

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-4-1 15:27:05

我这帖的内容除了“而且”开头的一句，可以一字不差地用在这里，连金属离子都一样……

wal 发表于 Post on 2025-4-1 11:57:46

scf不收敛按博文操作
http://sobereva.com/61

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