怎么获得CP2K做MM时的力场文件

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发布时间: 2025-4-9 22:03

本帖最后由 ljc2877437407 于 2025-4-9 22:13 编辑各位老师好，想请教一下怎么获得CP2K做QMMM时的力场文件呢，比如溶剂MM是乙腈，溶质QM吡啶（这里随便举的例子，可能不合适）

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ljc2877437407 发表于 Post on 2025-4-10 15:28:19

本帖最后由 ljc2877437407 于 2025-4-10 15:48 编辑

sobereva 发表于 2025-4-9 22:40
用AmberTools产生分子的拓扑文件，给CP2K用。CP2K支持AMBER、NAMD/CHARMM的拓扑文件

在北京科音CP2K第一 ...

sob老师，您好。按照您的意思，我将AmberTools文件安装好了，我的模型是乙腈包围了吡啶，只要将pdb文件上传上去，输出力场就可以了嘛，有没有需要特别关注的地方呢

238.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

模型图

sobereva 发表于 Post on 2025-4-9 22:40:50

用AmberTools产生分子的拓扑文件，给CP2K用。CP2K支持AMBER、NAMD/CHARMM的拓扑文件

在北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）的“分子力学与QM/MM计算”部分有MM和QM/MM计算的非常详细完整的例子

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