mpirun -np 48 cp2k.popt anneal.inpltee melt.out ,把提任务的命令改成这个。看你输出文件,你跨节点设置的应该不对。如果你服务器单节点是48,用popt跑。 |
logzzz 发表于 2025-4-13 10:35 -------------------------------------------------------------------------- Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted. -------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that process rank 13 with PID 186520 on node node114 exited on signal 9 (Killed). -------------------------------------------------------------------------- 这就是error文件的全部内容 |
这是我的输出文件 |
471.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 2
522 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2
需要提供比较详细的报错原因。有没有输出err文件?我8375C ,64核,计算只需要32 GB 的内存。你服务器应该不止30多GB内存吧?另外这个体系含氢,建议步长不要大于1 fs。 |
这是我的输入文件 |
28.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 10
能给输入文件尽可能给输入文件,免得别人去猜,导致来来回回浪费你和对方的时间,同时也便于别人测试 认真看 在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚 http://sobereva.com/620(http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html) |
Active 发表于 2025-4-12 16:21 当前物理内存大小、计算级别和体系大小分别是什么情况呢? |
Stardust0831 发表于 2025-4-12 16:15 老师你好,我判断很有可能是内存不够,这样的话请问我可以通过改动哪些参数来降低内存需要 |
这不是有效报错信息。cp2k意外中断都会这么报错。如果别的体系能在这个设备上正常算的话,可能是物理内存不够。具体需要检查你的输出文件。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-15 05:00 , Processed in 0.397135 second(s), 25 queries , Gzip On.