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求助用cp2k计算钙钛矿的分子动力学时出现如下报错

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发布时间: 2025-4-12 16:00

正文摘要:

-------------------------------------------------------------------------- Primary job  terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code. Per user-direction, the job has be ...

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logzzz 发表于 Post on 2025-4-13 12:43:46
mpirun -np 48 cp2k.popt anneal.inpltee melt.out   ,把提任务的命令改成这个。看你输出文件,你跨节点设置的应该不对。如果你服务器单节点是48,用popt跑。
Active 发表于 Post on 2025-4-13 12:15:47
logzzz 发表于 2025-4-13 10:35
需要提供比较详细的报错原因。有没有输出err文件?我8375C ,64核,计算只需要32 GB 的内存。你服务器应该 ...

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Primary job  terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
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mpirun noticed that process rank 13 with PID 186520 on node node114 exited on signal 9 (Killed).
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这就是error文件的全部内容
Active 发表于 Post on 2025-4-13 12:15:04
这是我的输出文件

out_53808.log

471.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

error_53808.log

522 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

logzzz 发表于 Post on 2025-4-13 10:35:45
需要提供比较详细的报错原因。有没有输出err文件?我8375C ,64核,计算只需要32 GB 的内存。你服务器应该不止30多GB内存吧?另外这个体系含氢,建议步长不要大于1 fs。
Active 发表于 Post on 2025-4-13 09:25:23
这是我的输入文件

anneal.inp

28.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

sobereva 发表于 Post on 2025-4-13 01:55:00
能给输入文件尽可能给输入文件,免得别人去猜,导致来来回回浪费你和对方的时间,同时也便于别人测试
认真看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
Stardust0831 发表于 Post on 2025-4-12 17:23:59
Active 发表于 2025-4-12 16:21
老师你好,我判断很有可能是内存不够,这样的话请问我可以通过改动哪些参数来降低内存需要

当前物理内存大小、计算级别和体系大小分别是什么情况呢?
Active 发表于 Post on 2025-4-12 16:21:00
Stardust0831 发表于 2025-4-12 16:15
这不是有效报错信息。cp2k意外中断都会这么报错。如果别的体系能在这个设备上正常算的话,可能是物理内存不 ...

老师你好,我判断很有可能是内存不够,这样的话请问我可以通过改动哪些参数来降低内存需要
Stardust0831 发表于 Post on 2025-4-12 16:15:00
这不是有效报错信息。cp2k意外中断都会这么报错。如果别的体系能在这个设备上正常算的话,可能是物理内存不够。具体需要检查你的输出文件。

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