乙醇水体系跑md时，出现分离现象

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发布时间: 2025-4-14 20:57

本帖最后由哇酷哇酷于 2025-4-15 11:12 编辑如图，乙醇（绿色）分散在了盒子的两边，正常情况下应该是均匀分混合的，不知道什么问题，这是我的mdp和top文件，请各位大佬指点下

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sobereva 发表于 Post on 2025-4-15 14:24:18

乙醇的拓扑文件里原子电荷都为0，都没法描述静电作用，结果当然离谱
sobtop主页http://sobereva.com/soft/Sobtop里明确说了设置原子电荷的事

哇酷哇酷 发表于 Post on 2025-4-15 11:14:48

sobereva 发表于 2025-4-15 03:59
拓扑文件要给就给全，#include "ethanol.itp"的拓扑文件根本没上传

抱歉sob老师，我现在上传了，麻烦您看下

sobereva 发表于 Post on 2025-4-15 03:59:46

拓扑文件要给就给全，#include "ethanol.itp"的拓扑文件根本没上传

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