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怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图，怎么确定正电中心和负电中心

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木鱼

发布时间: 2025-4-15 16:05

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sobereva 发表于 Post on 2025-4-17 14:58:11

木鱼发表于 2025-4-16 13:21
VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样，如何想和高斯里面的方向一致，应该怎么做呢

分清楚输入朝向和标准朝向的偶极矩，看下文了解朝向问题
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297（http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html）

木鱼 发表于 Post on 2025-4-16 13:21:38

sobereva 发表于 2025-4-16 04:34
Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后，主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样，如何想和高斯里面的方向一致，应该怎么做呢

木鱼 发表于 Post on 2025-4-16 13:18:11

sobereva 发表于 2025-4-16 04:34
Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后，主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

好的好的，感谢回复

sobereva 发表于 Post on 2025-4-16 04:34:35

Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后，主功能300的子功能5也可以算偶极矩矢量
之后用VMD的绘图命令自己绘制箭头，参考下文的脚本里牵扯的绘制命令
使用Multiwfn计算分子片段的偶极矩和复合物中单体的偶极矩
http://sobereva.com/558（http://bbs.keinsci.com/thread-18068-1-1.html）
（或者直接把整个体系作为一个片段，直接按上文的做法画图）

该写在正文里的内容别就光写在标题里

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