&COORD字段只需要原子顺序正确，根本不看其坐标

这种孤立小分子体系的反应过渡态不适合用CP2K算，直接Gaussian的opt(ts)不好么，实在要CI-NEB或者想用学术免费软件也可以上ORCA啊。孤立体系和周期性体系在杂化泛函的使用上差别明显，特别是CP2K还有http://sobereva.com/690的一大堆讲究，不宜乱尝试。

摆个好点的初猜大概率不用CI-NEB也能找到过渡态，而现在TS3.xyz一点都不像SN2取代反应的过渡态。

编辑：即使是要考虑显式溶剂分子，也可以取出反应物和若干溶剂分子组成的团簇当孤立体系处理。