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用甲醛分子和氧气分子生成碳酸分子,在用Dmol3寻找过渡态时出现报错,请问怎么解决?

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发布时间: 2025-4-26 11:23

正文摘要:

     ===============================================================      Materials Studio DMol^3 version 2023           & ...

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Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-4-26 16:13:54
快车奥斯卡 发表于 2025-4-26 15:38
解决了,调整了一下方程,打开SCF中的smearing

解决了啥呀,别再试图找“H2CO + O2 → H2CO3”的无催化剂气相双分子单步协同反应过渡态了,这种错误的建模既没有化学意义也无关你的实际体系。我不信既往研究没有类似的活性炭吸附配合物催化氧化反应可供参考,退一步讲不说吸附如何,有机钴配合物的催化反应总能找到吧。

由于缺少相应反馈,无法确定我说的每一点是否都把信息传达到位了,我不再跟进此帖。
快车奥斯卡 发表于 Post on 2025-4-26 15:04:57
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-26 14:57
具体是什么配位化合物,怎么吸附到石墨烯上的?请按http://sobereva.com/620来详细描述,每个帖子都尽量 ...

配位化合物是四磺酸单核酞菁钴,是因为本身是活性炭(用石墨烯结构代替),石墨烯表面上有亲水基团(手动添加)组成复合型结构催化剂。
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-4-26 14:57:08
快车奥斯卡 发表于 2025-4-26 14:41
是的,我也知道这个反应需要催化剂的参与,但是我的催化剂是配位化合物吸附到石墨烯上,然后吸附甲醛和氧 ...

具体是什么配位化合物,怎么吸附到石墨烯上的?请按http://sobereva.com/620来详细描述,每个帖子都尽量把信息提供完整了才可能提供帮助。

另外也不要忽视我说的软件的问题,参考http://sobereva.com/508的评论。
快车奥斯卡 发表于 Post on 2025-4-26 14:41:31
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-26 14:36
那显然不能抛开负载催化剂不谈嘛,当前两分子碰撞的模型相当于气相环境反应,完全没体现催化剂的作用。真 ...

是的,我也知道这个反应需要催化剂的参与,但是我的催化剂是配位化合物吸附到石墨烯上,然后吸附甲醛和氧气发生氧化,这个过程我知道,但是如何模拟就蒙了。
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-4-26 14:36:00
快车奥斯卡 发表于 2025-4-26 14:17
我实际研究就是负载型催化剂催化氧化甲醛成碳酸。关键我只知道反应物是氧气和甲醛,产物是碳酸。所以我想 ...

那显然不能抛开负载催化剂不谈嘛,当前两分子碰撞的模型相当于气相环境反应,完全没体现催化剂的作用。真实的反应历程应该是反应物分子吸附到催化剂表面,经过一系列吸附态的中间体得到产物,最后又从表面脱附的样子。研究类似催化反应的文献多了去了,都是先从构建一个负载催化剂表面的合理模型开始的,哪有上来就当孤立小分子反应硬找过渡态的。

计算软件这点,建议参考http://sobereva.com/706的第4个投票换更好的。
快车奥斯卡 发表于 Post on 2025-4-26 14:17:46
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-26 12:02
啊??你觉得能写出一个形式上的“H2CO + O2 → H2CO3”反应方程式,就一定存在对应的俩分子直接碰撞获得产 ...

我实际研究就是负载型催化剂催化氧化甲醛成碳酸。关键我只知道反应物是氧气和甲醛,产物是碳酸。所以我想试一下能不能找到中间的过渡态。
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-4-26 12:02:48
啊??你觉得能写出一个形式上的“H2CO + O2 → H2CO3”反应方程式,就一定存在对应的俩分子直接碰撞获得产物的微观过程,还试图按单步基元反应寻找过渡态??这是我至今看到的化学上最离谱的想法,相比之下M$都是次要的槽点了……不会是打算对比“H2CO + O2 → H2CO3”在气相直接反应和在催化剂表面反应的难易程度之类的吧,不妨描述一下实际研究体系的特征和计算要说明的问题。

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