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10W预算,购置CPU密集型LAMMPS分子动力学服务器,该如何改进?

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发布时间: 2025-4-30 14:04

正文摘要:

本帖最后由 JianyuC 于 2025-4-30 16:33 编辑 【采购背景】导师科研启动期,有10W预算可用于购置科研设备,但并非必须一次性用完。因之前”白嫖“国外某大学的超算服务器账号停用了,因此让我帮助配置一套自己的 ...

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JianyuC 发表于 Post on 2025-4-30 18:40:43
tonganlhy 发表于 2025-4-30 18:17
这样也行。单核强的多核U很贵,不如配两台分别专注不同类型的任务。
如果放在办公室,水冷有一定的必要 ...

非常感谢,我去调研一下
tonganlhy 发表于 Post on 2025-4-30 18:17:38
本帖最后由 tonganlhy 于 2025-4-30 18:22 编辑
JianyuC 发表于 2025-4-30 17:45
谢谢您的建议,这篇帖子我详细阅读过,我的情况比较符合文中:
这一情况。

这样也行。单核强的多核U很贵,不如配两台分别专注不同类型的任务。
如果放在办公室,水冷有一定的必要性。就是贵。参考本版有个9系双路水冷4000元。
JianyuC 发表于 Post on 2025-4-30 17:45:54
tonganlhy 发表于 2025-4-30 17:10
节点的管理说实话比较复杂。我要是你就紧一紧预算组两台双路9654说不定都够了。
这些CPU主频一般,上显卡 ...

谢谢您的建议,这篇帖子我详细阅读过,我的情况比较符合文中:
LAMMPS中有些pair_style不支持GPU加速,若你有可能用到这些pair_style,则应当另外配一台专注于CPU密集型任务的工作站/服务器

这一情况。

如果多节点没必要,那我是这样想:多核MPI在许多计算场景下都能用到,对LAMMPS来说也很高效,但如果一开始就按GPU加速来配置,对目前不能GPU加速的课题来说就感觉不太够用。如果配两台双路稍微有点超预算,或许现阶段先配置一台双路9654用着,剩下的预算先留着后续再物色一台GPU机器处理那些可能需要GPU加速的场景,这样做比较合适?双路应该也能很好地调度作业吧,只要能解决多任务的调度问题就可以。而且如果后期再加机器,这套拓扑也能用上,反正也不跨节点,就是ssh然后slurm这些应该还是搞得定。

另外,如果配双路那么考虑上水冷了,需要尽可能降低噪音,不知是否有必要。
tonganlhy 发表于 Post on 2025-4-30 17:10:10
节点的管理说实话比较复杂。我要是你就紧一紧预算组两台双路9654说不定都够了。
这些CPU主频一般,上显卡发挥不出性能。后面再上倒不如一开始就考虑。
方案可以参考这里,都很明了。http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html

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