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gromacs模拟添加wall设置后mdrun无法进行

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发布时间: 2025-5-7 18:00

正文摘要:

我建立了一个纤维素层+水层的模型,使用gromacs2018.8,进行NVT系综的分子动力学模拟,目的是观察400ps内水分子的蒸发行为,模型如图所示。 我初始采用的是三维周期性结构,发现由于纤维素中存在氢键,与水分子间 ...

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杂算者 发表于 Post on 2025-5-8 10:37:28
感谢社长提醒,我下次会注意!
sobereva 发表于 Post on 2025-5-7 21:31:38
让盒子底端留出一点真空区再试,别让原子一开始就越过盒子底端
sobereva 发表于 Post on 2025-5-7 21:29:41
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,导致信息零零碎碎,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

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