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计算二元水醇溶液体系的相互作用能符号与现实情况相悖该怎么解决

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Pekky

发布时间: 2025-5-9 10:55

正文摘要:

本帖最后由 Pekky 于 2025-5-9 10:52 编辑老师好，我的体系是水与正丁醇二元溶液，想做的是温度变化导致的相融合与相分离机理。水分子用的是spce模型，醇分子用的GAFF力场，电荷用的RESP2计算方法。盒子是packmo ...

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Pekky 发表于 Post on 2025-5-10 17:40:51

sobereva 发表于 2025-5-10 16:20
1 是。换之前版本做rerun

2 能

好的，感谢社长指导

sobereva 发表于 Post on 2025-5-10 16:20:46

Pekky 发表于 2025-5-10 13:51
好的谢谢老师解答，我这里还有几个问题想向老师请教一下：
1.这个是之前您回答过的cutoff_scheme=verlet ...

1 是。换之前版本做rerun

2 能

Pekky 发表于 Post on 2025-5-10 13:51:22

本帖最后由 Pekky 于 2025-5-10 14:36 编辑

sobereva 发表于 2025-5-9 17:01
之前本论坛里我就说过，cutoff_scheme = verlet时得到的组间相互作用能可能不正确，论坛首页全文搜索框搜我 ...

好的谢谢老师解答，我这里还有几个问题想向老师请教一下：
1.这个是之前您回答过的cutoff_scheme=verlet的bug导致的嘛，我现在的GROMACS版本为2020.6，试过了group但不支持，需要换成以前的版本嘛
2.我这个模拟是从低温到高温取5-6个温度点计算，从模拟结果提取径向分布函数，相互作用能以及分析氢键强度等等数据可以说明温度变化导致二元溶液从多相到单相的变化机理吗，不能的话，正确的模拟该是怎样的呢

sobereva 发表于 Post on 2025-5-9 17:01:48

之前本论坛里我就说过，cutoff_scheme = verlet时得到的组间相互作用能可能不正确，论坛首页全文搜索框搜我以前的回答

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