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求助羟基自由基攻击有机分子,搜索过渡态

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发布时间: 2025-5-9 14:32

正文摘要:

我们老师让我探究羟基自由基与这个分子(桃叶珊瑚苷)结合的反应机理,目前知道的是羟基自由基可以和羟基中的氢原子结合生成水,可以搜索到过渡态,但却用IRC验证失败。其次,我还猜想可能会攻击环上的碳碳单键、碳 ...

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Stardust0831 发表于 Post on 2025-5-10 01:53:16
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-5-10 01:55 编辑

“ 但是IRC变成这样”是变成了什么样呢?正常的IRC也有可能接近现在的情况。还是说,是轨迹折返了么?

如果是折返问题,可以看看这个《在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题 》(http://sobereva.com/400
Loading0760 发表于 Post on 2025-5-9 15:16:43
IRC验证失败是什么意思,反应路径不对?找到过渡态的时候先检查一下过渡态的振动频率对不对。
你的问题是什么,我没太看懂你这个提问的目的,是有的反应的过渡态没找到,还是找到了不对。还有你找过渡态的细节我也不清楚,例如泛函基组,还有单自由基电荷和自旋多重度的设置,这些细节都没说清楚。

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