gromacs跑完动力学后用gmxMMPBSA软件进行残基能量分解遇到问题

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发布时间: 2025-5-10 13:49

本帖最后由 lmtt 于 2025-5-10 13:49 编辑各位老师好，gromacs跑完抗原抗体动力学模拟之后，提取轨迹在gmxMMPBSA软件（1.6.1版本）进行残基能量分解，输入文件mmpbsa.in如（图1），发现输出文件FINAL_DECOMP_MMP ...

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student0618 发表于 Post on 2025-5-13 15:05:51

lmtt 发表于 Post on 2025-5-13 13:58:42

Loading0760 发表于 2025-5-12 10:45
试试改一下&pb里的inp参数,改成2看看会不会好点

不行欸，改成2后还是0

Loading0760 发表于 Post on 2025-5-12 10:45:06

试试改一下&pb里的inp参数,改成2看看会不会好点

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