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非标准残基建模，parmchk2参数检查出现(core dumped) "$AMBERHOME/bin/...

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gbl1218

发布时间: 2025-5-10 18:10

正文摘要:

本帖最后由 gbl1218 于 2025-5-10 18:10 编辑我的建模步骤： 1.将非标准残基提取，补全主链原子，进行高斯计算，输入文件见附件。 2.antechamber -fi pdb -i diam.pdb -bk DIA -fo ac -o dia_step1.ac -at amb ...

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madinlu 发表于 Post on 2025-7-3 22:01:48

解决了吗

18217265596 发表于 Post on 2025-5-11 11:41:34

别搞这么麻烦 antechamber做个mol2 然后parmchk2给他参数然后resp自己算填进去就行
或者sobtop做gmx格式再转amber

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