使用MMGBSA方法计算稳定蛋白质-配体体系自由结合能大于零

查看数: 369 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2025-5-11 11:32

本帖最后由 AxiEJohn 于 2025-5-11 11:34 编辑如题，本人在模拟蛋白质-配体复合体系时遇见即使是稳定在口袋后的蛋白质-配体体系，各项指标均表示体系趋向稳定后，计算出的结合能却为正数。本人甚至尝试换了一个 ...

回复 Reply

18217265596 发表于 Post on 2025-5-12 09:16:09

AxiEJohn 发表于 2025-5-11 21:14
谢谢您指点，我算一算。配置不太好得算一阵了

不用 PM7结合mozyne 一个结构4核 1小时内绝对算完

AxiEJohn 发表于 Post on 2025-5-11 21:14:27

18217265596 发表于 2025-5-11 11:39
分子力场误差大是正常的你要么试试半经验方法抽一帧算一下？比如PM7 看看正负是否一致

谢谢您指点，我算一算。配置不太好得算一阵了

18217265596 发表于 Post on 2025-5-11 11:39:33

分子力场误差大是正常的你要么试试半经验方法抽一帧算一下？比如PM7 看看正负是否一致

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register