求助 gromacs 插入分子链长度超过溶剂盒子边界是否会对动力学模拟产生较大影响

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发布时间: 2025-5-13 17:32

如图这种超过溶剂盒子边界的分子链会不会对接下来的分子动力学模拟产生较大的影响，主要是不想加入太多水分子，GPU 硬件比较落后，影响计算效率。计算的目的是分析分子链运动过程中回旋半径的变化，又不好真空下进行 ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-5-14 00:40:32

没有明显问题

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