求助高温NPT后聚合物链跑出盒子问题

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发布时间: 2025-5-15 21:10

我在使用gromacs模拟含有两种不同聚合物链共混的电解质体系，体系中一共有六条聚合物链，在423 K的温度下进行了50 ns的NPT过程，但是在模拟后聚合物链大部分跑出了盒子之外（一共有五种不同比例的共混体系最后都跑出 ...

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lhao9 发表于 Post on 2025-5-16 09:59:54

sobereva 发表于 2025-5-16 06:34
用了PBC，跑出盒子就根本不是什么“问题”

如果你的盒子空白的区域就是真空区而不是隐藏了溶剂分子，由 ...

好的谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2025-5-16 06:34:33

用了PBC，跑出盒子就根本不是什么“问题”

如果你的盒子空白的区域就是真空区而不是隐藏了溶剂分子，由于用了控压，自然盒子尺寸会在MD过程中显著收缩

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