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求助:利用静电势值和HOMO-LUMO gap值判断有机分子对金属离子的反应亲和性

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发布时间: 2025-5-19 00:05

正文摘要:

本帖最后由 zhangby 于 2025-5-19 00:06 编辑 各位老师好,我的研究体系中有以下几种分子结构(如下图1所示),想问一下各位老师,能不能通过静电势值判断该分子与金属离子亲和性,具体来说:静电势值越负,是否 ...

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zhangby 发表于 Post on 2025-5-19 12:03:52
sobereva 发表于 2025-5-19 06:17
就是一般意义的,参考:
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733(http://bb ...

非常感谢老师的解答
sobereva 发表于 Post on 2025-5-19 06:17:46
zhangby 发表于 2025-5-19 00:59
感谢老师的回复。
请问您说的“与金属离子的结合能”和“结合自由能”具体是指什么能呢?

就是一般意义的,参考:
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html
zhangby 发表于 Post on 2025-5-19 00:59:33
sobereva 发表于 2025-5-19 00:30
拿HOMO-LUMO gap根本说明不了什么问题,极其粗糙

用Multiwfn按下文获得结合金属位点处的表面静电势极值 ...

感谢老师的回复。
请问您说的“与金属离子的结合能”和“结合自由能”具体是指什么能呢?
sobereva 发表于 Post on 2025-5-19 00:30:53
拿HOMO-LUMO gap根本说明不了什么问题,极其粗糙

用Multiwfn按下文获得结合金属位点处的表面静电势极值点的静电势,可以用来比较结合的难易程度,然而这种做法并没有考虑结合位点的可极化特征的差异,而只是纯静电角度分析
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://sobereva.com/159

如果结合可极化特征讨论,可以同时查看Multiwfn给出的结合位点的ALIE,数值越小越容易极化,可能配位作用越强。ALIE和静电势一样也可以作图考察
使用Multiwfn和VMD绘制平均局部离子化能(ALIE)着色的分子表面图(含视频演示)
http://sobereva.com/514http://bbs.keinsci.com/thread-14632-1-1.html

由于体系很小,计算与金属离子的结合能非常容易,因此应当以结合自由能作为最终判据,而建议以上分析主要用于解释差异的目的。

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