gromacs拉伸变形很快，最后导致系统崩溃

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发布时间: 2025-5-20 16:09

本帖最后由 zongshu 于 2025-5-20 16:09 编辑采用的力场是oplsaa.ff 第一个图是模拟前的，尺寸是12nm。第二个是拉伸20ps后的，尺寸盒子变得很大，成了几千纳米。不知道为什么变形这么快。我得代码如下 pcoupl&n ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-5-21 05:57:53

先确保不做deform设置能正常模拟

盒子尺寸显著变化的过程甭用PR压浴。用Berendsen压浴

这叫关键词或者设置，不叫“代码”

用pull_pbc_ref_prev_step_com意义不明，当前跟pull根本没关系

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