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求助:MS建立AC盒子后,进行几何优化与退火后煤分子密度大幅度降低

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发布时间: 2025-5-22 17:58

正文摘要:

老师同学们好,我在建立完煤分子模型后,首先进行了几何优化和300-600K下NVT系综下退火,得到能量最低的煤分子模型,然后我在此煤分子模型的基础上,建立一个密度为1.0的AC盒子,然后再进行几何优化,发现密度降到0. ...

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smeli 发表于 Post on 2025-5-23 22:44:47
WJLSSS 发表于 2025-5-23 16:23
补充,希望我们能一起解决这个问题

好的,感谢感谢,有消息通知你
WJLSSS 发表于 Post on 2025-5-23 16:23:35
补充,希望我们能一起解决这个问题

202505231623097384..png (25.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

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WJLSSS 发表于 Post on 2025-5-23 16:11:20
这些是我整理在论坛找到的一些相关的内容。(1.检查力场电荷 2.阴阳离子分开处理 3.是否使用前面系综的最后一帧 4.体系是否平衡)你可以看看这些,不过我还是没解决

202505231607395822..jpg (411.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

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202505231607543698..png (254.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

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smeli 发表于 Post on 2025-5-23 14:43:07
WJLSSS 发表于 2025-5-23 11:57
我感觉不是时间不够长的原因吧  我这个密度已经完全掉下去了,给再多的时间密度也不会再上来。我这个是先 ...

可能跟物质所需要的力场有关吧,要不改变改变力场,或者系综,我的是煤分子,我准备先nvt退火,再npt动力学试试
WJLSSS 发表于 Post on 2025-5-23 11:57:05
smeli 发表于 2025-5-23 08:51
可能是时间不够长,或者是先nvt再npt

我感觉不是时间不够长的原因吧  我这个密度已经完全掉下去了,给再多的时间密度也不会再上来。我这个是先NVE之后再NPT,我组里面的师兄也是这样先NVE后NPT他那边就比较正常,密度稍微下降一点然后就趋于稳定。
smeli 发表于 Post on 2025-5-23 08:51:06
WJLSSS 发表于 2025-5-22 19:35
我也在NPT后遇到类似的问题,楼主解决了吗,解决了可以踢踢我吗

可能是时间不够长,或者是先nvt再npt
WJLSSS 发表于 Post on 2025-5-22 19:35:14
我也在NPT后遇到类似的问题,楼主解决了吗,解决了可以踢踢我吗

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