“第25届北京科音初级量子化学培训班” 将于6月11至14日于北京举办,是初学者真正从头一次性完整、系统性学习量子化学计算,从而能很快上手量子化学研究的重要机会,比起自己摸索、鼓捣能少走无数弯路。报名正在进行中,请点击此链接查看,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

关于将分开的双层膜合并

查看数: 538 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2025-5-24 20:10

正文摘要:

大家好。   我能过Amber作的lipid双层膜的MD。   初始时,还是保持好的双层膜。   在分析的时候,我希望将分开的双层膜给合并回来。   我通过   center ":PC| :OL | :PA" origin   &nb ...

回复 Reply

meatball1982 发表于 Post on 2025-5-25 09:06:16
谢谢sob大的回复,我尝试一下。
sobereva 发表于 Post on 2025-5-25 06:27:11
把盒子显示出来就知道是怎么回事了
gromacs的trjconv结合-center可以把选定的组居中,避免平移到盒子边界。也可以在模拟过程中设置磷脂部分消除整体平动避免出现这种现象

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-6-1 23:16 , Processed in 0.664856 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list