求助：如何提取MD生成相里的二聚体

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发布时间: 2025-5-28 17:00

各位老师好，我做了一个单一分子的体系，现在我想提取二聚体进行DFT分析，那我该如何做，我看文献里别人都是设定了接触距离和接触原子数进行筛选（这里的接触原子数是怎么定义的是在index里定义吗），类似图1，要是 ...

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科研小白0126 发表于 Post on 2025-5-29 15:36:22

sobereva 发表于 2025-5-29 08:34
都靠自己写脚本实现，诸如VMD tcl脚本

循环每一对分子，计算其中每一对分子间原子间距离，结合判断条件 ...

原来如此，谢谢sob老师

sobereva 发表于 Post on 2025-5-29 08:34:50

都靠自己写脚本实现，诸如VMD tcl脚本

循环每一对分子，计算其中每一对分子间原子间距离，结合判断条件统计各种接触方式

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