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原子数一千多,半经验优化一直失败

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qyl
发布时间: 2025-6-3 16:16

正文摘要:

想用半经验简单优化一下,得到mmff94电荷,进而跑动力学模拟,半经验优化 一直失败,降低收敛标准仍然失败。

回复 Reply

wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-4 20:56:35
qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直 ...

对。我没注意你需要的是MMFF94电荷,那更是连重复单元优化都不需要
qyl 发表于 Post on 2025-6-4 09:25:38
sobereva 发表于 2025-6-3 23:05
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系,优化结构毫无意义、完全多余

好的,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2025-6-3 23:05:56
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系,优化结构毫无意义、完全多余

看此文了解不同原子电荷计算的基本原理
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html

qyl 发表于 Post on 2025-6-3 22:45:12
18217265596 发表于 2025-6-3 21:42
你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要

好的,谢谢啦
18217265596 发表于 Post on 2025-6-3 21:42:36
qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直 ...

你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要
qyl 发表于 Post on 2025-6-3 20:29:33
wzkchem5 发表于 2025-6-3 18:31
聚合物产生电荷的方法是截取片段(例如往往取3个左右的重复单元)产生电荷,不要拿整个聚合物做结构优化、 ...

聚合物截取重复单元做优化,仅仅为了得到resp电荷,最后做动力学模拟时,其实只要得到resp电荷,就可以直接做动力学模拟,没必要对分子做优化处理。这样理解对吗?谢谢啦
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-3 18:31:18
聚合物产生电荷的方法是截取片段(例如往往取3个左右的重复单元)产生电荷,不要拿整个聚合物做结构优化、产生电荷,既浪费机时,结果又未必更准。
18217265596 发表于 Post on 2025-6-3 18:29:16
本帖最后由 18217265596 于 2025-6-3 18:30 编辑

这种体系,欢迎拥抱gfnff或者gfn0/1 xtb
算的又快又好
我粗看了一眼 你这全是重复单元 你为什么不按单元算?

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