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蛋白小分子复合物MD,RMSD起始帧不唯一,图像波动很小

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发布时间: 2025-6-3 20:26

正文摘要:

如题,使用同源建模的蛋白质进行,amber14sb立场,小分子使用sobtop处理后使用GAFF立场,运行100ns后得出结果,进行预处理的代码分别是: gmx trjconv -s md_0_10.tpr -f md_0_10.xtc -n index.ndx -o md_0_10_cent ...

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