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IRC曲线不够smooth

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beyond

发布时间: 2025-6-6 05:22

正文摘要:

本帖最后由 beyond 于 2025-6-6 05:27 编辑使用orca 6.0.1 跑一个加成反应的机理，已经跑完了minimization，frequency calculation，TS也找到了。然后开始跑IRC，下面是输入文件： ! PBE0 def2-TZVP D3 ...

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harden 发表于 Post on 2025-7-3 20:24:53

wzkchem5 发表于 2025-7-3 10:31
你去看out文件，会看到一个每步的能量的表，复制进origin就行了
如果不知道在哪看，让AI替你分析，并告 ...

喔喔好的谢谢老师！

wzkchem5 发表于 Post on 2025-7-3 10:31:11

harden 发表于 2025-7-2 15:45
喔喔谢谢老师解答!我还想请教一下老师，它的IRC_Full_trj.xyz文件里面的数据都是给好的，但是一个一个点 ...

你去看out文件，会看到一个每步的能量的表，复制进origin就行了
如果不知道在哪看，让AI替你分析，并告诉你分析的方法

harden 发表于 Post on 2025-7-2 15:45:35

wzkchem5 发表于 2025-7-2 11:43
数据点多可能是因为过渡态的结构同时出现在F和B的文件里
需要自己导入Origin等软件作图，但更方便的做法 ...

喔喔谢谢老师解答!我还想请教一下老师，它的IRC_Full_trj.xyz文件里面的数据都是给好的，但是一个一个点去扣数据还是太慢了，我该怎么从out文件里获取数据嘞，我暂时还没找到网上有ORCA做IRC分析的相关知识，求老师解答。

wzkchem5 发表于 Post on 2025-7-2 11:43:15

harden 发表于 2025-7-2 10:27
师兄，你是怎么处理你跑完IRC的数据的呀，他跑完有IRC_F_trj.xyz文件，IRC_Full_trj.xyz文件以及IRC_B_trj. ...

数据点多可能是因为过渡态的结构同时出现在F和B的文件里
需要自己导入Origin等软件作图，但更方便的做法是从out文件获取作图所需的数据

harden 发表于 Post on 2025-7-2 10:27:44

师兄，你是怎么处理你跑完IRC的数据的呀，他跑完有IRC_F_trj.xyz文件，IRC_Full_trj.xyz文件以及IRC_B_trj.xyz文件，我看使用手册说F和B文件是反应向前向后的文件，但是这个FULL文件不应该是总体的吗，但是F和B文件的数据点加起来比FULL的要多，并且我们要怎么处理这些数据呀，自己导入到绘图软件里画图嘛，求师兄解答

beyond 发表于 Post on 2025-6-6 20:42:18

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-6 09:44
ORCA论坛的https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=11041一帖可能也反映了类似问题。至今ORCA ...

好的，十分感谢！

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-6-6 09:44:54

ORCA论坛的https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=11041一帖可能也反映了类似问题。至今ORCA也只能在笛卡尔坐标下获得MEP，无法在质权坐标下获得正宗的IRC，各step横坐标单位只是埃之类的长度单位而非质权的sqrt(amu)*bohr等单位，所以ORCA所得结果与一般概念的IRC曲线形状可能会不同。不妨按http://sobereva.com/422的指导联用Gaussian来跑IRC。

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