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在分子体系中加二氯甲烷显式溶剂,为什么二氯甲烷分子和我计算的体系连在一起了?

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发布时间: 2025-6-6 20:40

正文摘要:

本人想在分子体系中加二氯甲烷显式溶剂,想先加一个分子试一下,可是为什么二氯甲烷分子和我计算的体系连在一起了? 同时请问一下加入显示溶剂的话,我的输入文件是正确的吗? 可能问题比较低级,谢谢老师答复 ...

回复 Reply

wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-17 12:17:28
ouou 发表于 2025-6-17 11:18
请问应该怎么加阴离子呀,问题有点低级还请见谅,谢谢

(1)根据实验条件,确定你需要加哪种阴离子,例如Cl-、BF4-、OTf-等
(2)把这个离子放到Zn旁边,让它和Zn的距离近似等于单键键长。Zn-X单键键长等于Zn的共价半径加上X的共价半径,共价半径自己查
(3)把总体系的电荷减1,自旋多重度不变
ouou 发表于 Post on 2025-6-17 11:18:07
dnlx 发表于 2025-6-8 09:28
下载了输入文件才发现,你给出的结构不是中性分子,而是阳离子。所以你应该加阴离子,让阴离子和锌配位。

请问应该怎么加阴离子呀,问题有点低级还请见谅,谢谢
ouou 发表于 Post on 2025-6-9 09:33:48
sobereva 发表于 2025-6-7 02:09
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

谢谢老师
dnlx 发表于 Post on 2025-6-8 09:28:35
下载了输入文件才发现,你给出的结构不是中性分子,而是阳离子。所以你应该加阴离子,让阴离子和锌配位。
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-8 08:31:32
dnlx 发表于 2025-6-8 04:23
还有一种可能是二聚体乃至多聚体,每个单体分子用氮、硫或氧给另一个单体的锌配位。

对,不过那样的话估计会从溶液里沉淀出来,做实验的人会发现
dnlx 发表于 Post on 2025-6-8 04:23:32
本帖最后由 dnlx 于 2025-6-8 04:24 编辑
wzkchem5 发表于 2025-6-7 09:35
Zn的空配位点很难与CH2Cl2配位,但凡体系里有痕量的配位性溶剂(包括但不限于水),就和配位性溶剂配位了。 ...

还有一种可能是二聚体乃至多聚体,每个单体分子用氮、硫或氧给另一个单体的锌配位。
wzkchem5 发表于 Post on 2025-6-7 09:35:09
Zn的空配位点很难与CH2Cl2配位,但凡体系里有痕量的配位性溶剂(包括但不限于水),就和配位性溶剂配位了。
建议确认体系是不是绝对干燥,绝对不含任何配位性溶剂,如果不是,所含的配位性溶剂主要是什么
sobereva 发表于 Post on 2025-6-7 02:09:00
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “在gview中构建显示溶剂模型” 改了,以后务必注意

认真看此文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html

关键词没明显问题。B 23 40 F意义不明。不推荐给Zn用过时的Lanl2DZ,看下文
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html


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