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gmx sham自由能貌图的绘制问题，没有gibbs.xpm

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lxhpdx

发布时间: 2025-6-8 21:53

正文摘要:

在获得pc1和pc2的2d.xvg之后，使用以下命令处理 gmx sham -f 2d.xvg -ls gibbs.xpm -ngrid 200 200 200 -nlevels 100 但是输出结果只有bindex.ndx,shamlog.log,ener.xvg,并没有gibbs.xpm文件，这 ...

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喵星大佬 发表于 Post on 2025-6-10 02:39:19

你要正确设置你的作图范围

13277552957 发表于 Post on 2025-6-9 19:54:30

首先确保2d.xvg文件整合正确，只有三列数据，然后使用这行命令
gmx sham -f 2d.xvg -ls gibbs.xpm -nlevels 100

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