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求助:关于用BOMD模块定性分析质谱

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发布时间: 2025-6-12 02:24

正文摘要:

本帖最后由 gezq 于 2025-6-12 12:58 编辑 各位老师,我测了一个有机物的质谱,发现有一些气体产生,如果我想定性分析一下这个质谱结果,能不能按照如下方法: 1st step:先用BOMD模块在500K下让中性分子M跑10 p ...

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sobereva 发表于 Post on 2025-6-17 06:26:37
gezq 发表于 2025-6-16 16:36
好的老师。那请问能不能用这么一个方法,即我考虑该分子发生内转换,S1态内转换回基态的能量转换成核的动 ...

直接在ORCA里设电子温度跑动力学就完了。没必要这样。被被人质疑起来也没文献支撑
sobereva 发表于 Post on 2025-6-15 05:14:18
gezq 发表于 2025-6-14 21:24
我又阅读了一下这篇Angew,Grimme的意思是说,电子与有机分子相互作用后,会有一部分过剩能量(impact ex ...

1 无
2 不支持
3 核的温度
4 北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)“从头算分子动力学”部分超级详细讲了怎么用ORCA做AIMD,没必要拘泥于Gaussian。本来就算不牵扯FON的事,我也更推荐用ORCA跑AIMD
gezq 发表于 Post on 2025-6-14 21:24:46
本帖最后由 gezq 于 2025-6-15 00:08 编辑
sobereva 发表于 2025-6-14 04:42
根本没有这种写法
temperature(你当前的temp=)关键词对BOMD计算没有丝毫影响,而且也不影响SCF=Fermi ...

我又阅读了一下这篇Angew,Grimme的意思是说,电子与有机分子相互作用后,会有一部分过剩能量(impact excess energy,IEE),这个过剩的能量中一部分使电子激发,另一部分转换成振动能,其中电子从激发态转换至基态后,电子的温度可以等效为10000K(PBE0泛函),而核的等效温度则通过另一方程近似得到,但核的等效温度是远低于电子的等效温度的,我大约计算了一下,约1600K。基于此,想请教老师几个问题:(1)我的理解是否有偏差?(2)Gaussian是否支持FON技术?(3)上述BOMD中的rtemp具体指的应该是核的温度吧?(4)在我仅会Gaussian的BOMD模块计算的情况下,我应当如何选择合适的温度?(5)或者,我能不能这样来计算,即:我在升温核等效温度的同时,让电子保持在激发态,这样就避免了引入电子的等效温度,即只考虑振动激发态的内转换,却选择性不考虑电子内转换(此处应当需要计算激发态的寿命)。
sobereva 发表于 Post on 2025-6-14 04:42:33
gezq 发表于 2025-6-14 02:10
老师,再麻烦您帮学生确定一下,我用BOMD模块设置的关键词是正确的吧。其中核的温度是500K,电子温度是10 ...

根本没有这种写法
temperature(你当前的temp=)关键词对BOMD计算没有丝毫影响,而且也不影响SCF=Fermi的效果。Gaussian没法做基于有限(电子)温度DFT的BOMD计算
gezq 发表于 Post on 2025-6-13 11:41:25
sobereva 发表于 2025-6-13 02:45
可以。可以先这么跑跑看看情况

好的,谢谢老师
sobereva 发表于 Post on 2025-6-13 02:45:41
gezq 发表于 2025-6-12 11:16
好的,老师,温度的公式来源于文献 Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306–6312的SI部分,如上图

可以。可以先这么跑跑看看情况
gezq 发表于 Post on 2025-6-12 11:16:12
sobereva 发表于 2025-6-12 05:12
说清楚确定温度的公式是哪来的

好的,老师,温度的公式来源于文献 Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306–6312的SI部分,如上图
sobereva 发表于 Post on 2025-6-12 05:12:07
说清楚确定温度的公式是哪来的

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