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请教，TiC周期性材料与壳聚糖一起模拟后轨迹显示壳聚糖不运动

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Eianghuan

发布时间: 2025-6-18 11:09

正文摘要:

本帖最后由 Eianghuan 于 2025-6-18 11:19 编辑请教各位老师，我分别依照Sobtop例5（产生聚合度为40的氯丁二烯聚合物的拓扑文件）和例11-懒人法（产生FeCl2二维材料的拓扑文件）为20个单元的壳聚糖（20CCS）和10 ...

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Eianghuan 发表于 Post on 2025-6-19 09:54:25

sobereva 发表于 2025-6-19 07:02
rlist、rcoulomb、rvdw都严重小得离谱。没特殊情况都用1.0
当前体系明显应当半各向同性控压
热浴改成好得 ...

好的，谢谢Sob老师！感谢您的耐心回复，学习到了

sobereva 发表于 Post on 2025-6-19 07:02:51

rlist、rcoulomb、rvdw都严重小得离谱。没特殊情况都用1.0
当前体系明显应当半各向同性控压
热浴改成好得多的v-rescale。过时的Nose-Hoover如今没有任何使用理由
先单独跑聚合物的NPT动力学（用c-rescale压浴），确保没问题再说复合体系的事。若温度不够高导致动不起来，用更高的温度。

PS：我特别反感设置fourierspacing = 0.16，以讹传讹

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