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关于文章中苯环形成过程中 过渡态的虚频问题

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cym
发布时间: 2025-6-19 09:19

正文摘要:

http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract30064.shtml 通过价层电子密度分析展现分子电子结构 (pku.edu.cn) 求教:上述链接文章中Figure 8 中苯环形成过程中 过渡态的虚频问题,过渡态不是只有一个虚频 ...

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cym 发表于 Post on 2025-6-20 17:25:31
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-20 17:09
这是另一个问题了。找过渡态一般需要凭化学直觉摆个初猜来优化,比如这里Diels-Alder反应可以尝试先优化 ...

好的,我再学习一下。感谢您的回复
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-6-20 17:09:59
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-6-20 17:11 编辑
cym 发表于 2025-6-20 16:53
您好,我看了您分享的博文。但是Figute8的这种过渡态怎么搜索呢?自己尝试了计算算不出来。麻烦您指点一 ...

这是另一个问题了。找过渡态一般需要凭化学直觉摆个初猜来优化,比如这里Diels-Alder反应可以尝试先优化单分子产物环己烯的船式构象,再把对应于乙烯与丁二烯的两个片段距离拉开,即增长两个碳碳键,作为初始结构。要是缺乏这种化学直觉,就去找那些涉及反应势垒的benchmark文章,看看数据集里过渡态结构一般都长什么样,比如当前这个最简单的Diels-Alder反应就在GMTKN55的周环反应子集里有。

单说“自己尝试了计算算不出来”没办法有针对性地回答,得详细描述尝试的过程、提供相关文件。

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cym 发表于 Post on 2025-6-20 16:53:23
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-6-19 10:16
无论是实频还是虚频,一个简正振动模式可以涉及很多个键长键角二面角的变化,即由很多内坐标的耦合运动产生 ...

您好,我看了您分享的博文。但是Figute8的这种过渡态怎么搜索呢?自己尝试了计算算不出来。麻烦您指点一下
cym 发表于 Post on 2025-6-19 15:10:14
sobereva 发表于 2025-6-19 14:37
同一个问题别在论坛里两处问,刚在http://bbs.keinsci.com/thread-6869-1-1.html里回完你的问题

谢谢卢老师提醒,下次我一定注意
sobereva 发表于 Post on 2025-6-19 14:37:04
同一个问题别在论坛里两处问,刚在http://bbs.keinsci.com/thread-6869-1-1.html里回完你的问题
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-6-19 10:16:51
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-6-19 10:25 编辑

无论是实频还是虚频,一个简正振动模式可以涉及很多个键长键角二面角的变化,即由很多内坐标的耦合运动产生。过渡态的确有且只有一个总体的振动虚频,但并未限定只有单一内坐标做主要贡献。参考下述博文
Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes
http://sobereva.com/106

这种常规的Diels-Alder反应形成的不是苯环而是环己烯,能形成苯环(或者更确切地说是苯炔)的那种叫Hexadehydro Diels-Alder反应

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cym + 5 牛!

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pal 发表于 Post on 2025-6-19 09:35:02
不明白为什么会产生两个虚频,这不就对应于一种振动模式

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cym + 2 谢谢

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