求助纯聚合物体系Gromacs拉伸动力学pull命令设置

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发布时间: 2025-6-19 23:44

纯聚合物体系，正常完成了能量最小化 npt过程，压缩成为了致密体系，想要下一步进行拉伸动力学，使用pull命令，但是发现产生相prod.gro原子没有都在盒子里面，拉伸时需要设定left和right原子，不知道怎么设置 1.关 ...

回复 Reply

科研小白0126 发表于 Post on 2025-8-23 00:09:48

您好我想问一下就是这种大的有机分子该怎么构建他的聚合物的top和itp啊

多聚体.PNG (18.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

sobereva 发表于 Post on 2025-6-22 07:23:21

这种目的在mdp里设deform让盒子逐渐缩小就完了，不是用pull的场合

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